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粒子只会散漫地堆叠在一起，按照能量最低原理形成各种结构，质子、中子、原子核。人们孜孜不倦地追求新的高能粒子的发现，却没想过即使发现了这些高能粒子，它们却对现阶段的人类没有任何作用！
人类利用物质的能力，向来是循序渐进的。例如，能够自由建设宏观的机器设备，于是人们就可以建造加速器，研究物质的微观结构，然后发现并能够利用核能，这是对人类有用的。后来，人类能够操纵微观的分子和原子，形成各种各样特殊性质的东西，然而，他们还没掌握原子层级的操控技术的时候，就好高骛远地向物质的更深层次发起冲击，寻找夸克、‘消失的粒子（这里指希格斯粒子）’，甚至试图寻找夸克层级以下的东西，实际上，这些步伐迈得过早了！有这个时间、精力和金钱，还不如去研究如何熟练操控分子和原子，站稳这一步之后就研究如何操控重子，当人类研究透重子之后，这时才是向夸克以下层级进军的时候。”
“……许多年后，人们发现建造更高能量的加速器越来越困难，想要追求物质的本源、宇宙的初始，所需要粒子的能量越来越高，人们却没有足够厉害的材料可供使用，那么获得这种粒子的困难度简直比天文数字还可怕！此时，人们遭到了挫败，这才回过头来研究如何才能自由地操控粒子，然后一步步稳扎稳打地向更深层次迈进……”
“……这，是我们文明在探索物质本质的过程中走过的弯路，现在我们记录下来，希望别的尚未发展起来的文明能够获得这份资料，不要再走我们走过的弯路。”
看到这里，刘云才明白，原来系统是在搜刮别的文明的技术资料，然后丢给玩家去研究，而玩家基本上是地球人（“主神”们的敌人是仙人，仙人的后裔是华人，不是外星人），至于玩家能不能看懂就不知道了。
这份资料说了一大堆他们的“科学史”之后，才说到真正的技术内容，要操控重子，首先就要建造许多个结构精巧的加速器，能量不用太高，但结构很特殊，很精巧。要知道，原子核的直径只有飞米（10E－15米）的量级，是纳米的一百万分之一，操纵原子就是一项精细的工作，何况操纵重子了。所以，这些加速器的核心部件有时候要精确到每一个原子，在关键部位若是多了一个原子，可能就要坏事，所以，难度非常高。而且，就如资料里所说的，操控重子之前，先要掌握如何自由操控分子和原子，所以这里又附加了一大堆纳米技术的资料。
“靠！说了半天，正课还没开始，还得上补习班！”刘云相当气愤，本来他以为能学到什么高深的技术，没想到技术太高深了，需要先上补习班，先打好基础才行！
“噗哧！”梅青看到刘云那个样子，忍不住笑了。刘云瞪了她一眼，“笑什么笑！我不是在着急嘛，真是的，这系统，搞这么高深的东西给我，到头来看得见吃不着。”刘云一脸愤愤的样子，似乎系统卖假药给他似的。
“我没笑……嘻嘻……”梅青掩着小嘴，努力忍住笑意，半天才平静下来，劝道，“其实，这里说得没错，路要一步一步走，饭要一口一口吃，循序渐进总是最好的办法。我知道你的心神能够操控原子，但这只是你功法的作用，并不表示你已经掌握了这种技术，即使你成功建成那种加速器，也只是空中楼阁而已。何况，这里还提供了许多纳米技术，我们为何不趁机吸收利用呢？利用好了，我们的技术也能迈上一个台阶！”
“嗯，也是。”刘云只是小发点脾气，过后就好了，然后就开始钻研起纳米技术来。不得不说，比起操控重子的技术，纳米技术实在是简单多了，现在刘云的强悍心神可以直接操控原子，所以研究起纳米技术来实在是得心应手，他们以前也有纳米技术，但那只是很初级的那种，就像二十一世纪初人类的纳米技术一样。那种纳米技术，只能搞搞“防水布”，“不用洗的衣服”，“优良的电池”等等，科研方面也只是整天玩一点“碳纳米管”，或者纳米管里装些乱七八糟的东西，然后就可以写论文，发表……咳，扯远了，这是在地球时的工作。
这种纳米技术，首先就是制造纳米机器人。制造纳米机器人可不能像制造碳纳米管那样，用化学物理手段生成一大堆纳米管，然后从中挑选比较好的那部分。制造纳米机器人需要一个一个地移动原子，用原子搭建出一个纳米机器人。所以，制造纳米机器人的基本设备是一些超精密原子显微镜，就是能用针尖“看到”原子，并且移动原子的显微镜，不过这种显微镜拥有多个针尖，可以用原子搭建立体的结构，而不是IBM那种只能在平面上移动原子的层次。是的，这是一项很精细的工作，而且只能造出一个，只有一个纳米器件，太少了，不是吗？当然，一个纳米机器人显然无法派上用场，而日后批量的纳米机器人也不能通过移动原子的方式来制造，必须让纳米机器人可以自我复制。
要让纳米机器人能够自我复制，这可不是一项简单的工作，这是一项复杂的系统工程。资料上说：“要让一个东西自我复制，那么你最好的老师不是别人，正是生物本身。生命是自然界最神奇的创造物，人们可以从中学到许多东西。我们知道，细胞中有DNA、RNA、核糖体、ATP和其他细胞器，其中DNA用来储存信息，一部分RNA用来转录信息，DNA可以自我复制，而RNA可以通过DNA制造出来，核糖体是蛋白质的‘制造工厂’，ATP是细胞的能源。那么我们可以模仿生物，制造出拥有这样功能的纳米机器人。
首先，是类似DNA的纳米机器人，我们叫它‘记忆体’，其结构我们也可以模仿生物，做成双链型，而双链的每一对单元都必须互相配对，那么我们可以设计一些互相吻合的结构。不过，单单DNA无法自我复制，生物里面DNA的复制还需要一些酶，那么我们也可以制造类似功能的纳米机器人，我们叫它‘催化体’，然后记忆体的自我复制需要能量，我们也可以制造一些拥有较高化学能，可以重复‘充电’使用的‘能量体’，这种能量体的结构必须和催化体，以及后面用来组装的纳米机器人吻合，其化学能可以方便地使用……”
具体的纳米技术还是很复杂，不过，总体原理是模仿生物，DNA对应记忆体，RNA对应转录体，酶对应催化体，ATP对应能量体，核糖体对应装配体。其中，装配体这种纳米机器人可以由能量体提供能量，然后可以移动原子，组装成复杂的结构，同时，记忆体上面的信息对应一套“装配密码”，可以指挥装配体移动不同的原子，组装成不同的结构，这个装配密码可以由研究者自行设定，只要能让装配体成功实现装配步骤就行，不能出现任何差错！最后，这种装配体必须能制造其本身，并能制造除记忆体和转录体之外的任何纳米机器人。当然，如果组装能量体的话，是无法组装出高能态的能量体的，只能组装出低能态的能量体，然后通过一个“充电”过程，给能量体补充能量。
这里要提一下这个“能量体”，它不是像生物那样，通过吃掉有机物，然后氧化，有机物能量被ADP吸收，形成ATP，这种叫做能量体的纳米机器人，可以通过电能来达到高能态，不需要什么有机物，这就是纳米机器人的多样性，竟然能实现这种功能。实际上，能量体分两部分，低能态时是电离的，电离后带了大量的电荷（纳米机器人也算是大分子），只需在能量子溶液里通电，那么能量体的两部分就会在阴极处结合，电能转化为化学能储存起来。这样是为了方便大量生产纳米机器人，只需大量的电能就可以批量生产，不像生物那样需要喂食，然后等它养大最后生崽。
有了这些纳米机器人，那么就可以大量复制了。事实上，要得到这些纳米机器人的合理结构，需要无数次试验，而今刘云直接得到这些资料，就可以自行制造了。另外，刘云不需要制造什么超精密原子显微镜，不需要仪器，只需心神程序就能移动原子，并且自由组合，这真是逆天的技能，所以得知那些纳米机器人的结构后，立刻就可以制造了。
除了可以用记忆体上面的信息来控制纳米机器人的行为，还可以在纳米机器人的某部位上安装磁性端，这样就可以用精细磁场来辅助控制纳米机器人。另外，纳米机器人的自我复制必须受到控制，不能像病毒一样肆无忌惮地复制，所以，必须加入“总开关”，可以通过特殊的催化体来实现总开关的功能，另外也可以模仿自然界生物DNA的端粒，给记忆体安装一段复制一次就缩短一次的端粒，用来控制其寿命，生物细胞的寿命就是由DNA的端粒来控制的（还有端粒酶可以加长和修补端粒，这种端粒酶一般出现在生殖细胞等无限复制的细胞之中）。
数日后，刘云手中拿着一个培养皿，啧啧叹道：“这些纳米机器人，这些个小玩意儿，竟然也能制造大型机械？真是太不可思议了。”
梅青嗔怪地瞪了他一眼，道：“得了吧，瞧你那口气，看似自谦，实际上是在炫耀，天下间也就只有你才能在短短数天内做出这么成功的纳米机器人了。”
刘云得意地捏了一把梅青娇嫩的脸蛋，倒是闹了她一个大红脸。刘云嘿嘿笑道：“怕羞什么，天经地义的事情……咳咳！”刘云在梅青红着脸把手指伸到他腰间之前，立即摆出一副“正人君子”的嘴脸，道，“其实，这些纳米机器人的最成功之处，还在于可以用电磁信号控制它们的建造，否则光靠记忆体，也就是类似DNA的东西来控制，那速度可是慢得紧，那么我们只需配好蕴含各种原材料的‘营养液’，补充足够的能量体溶液，就可以让这些纳米机器人来建造我们能造的任何东西，什么光电芯片、硬盘等电子设备，还有枪支弹药，甚至是坦克军舰这一类大型机械……不过，现在还没法建造大型机械，我们得好好研究大型机械的建造步骤才行，这个得等一段时间。”
现在，刘云的纳米机器人已经可以建造一些小东西了，例如，刘云现在将培养皿里的纳米机器人倒入一个较大的培养缸里，然后充入营养液和能量体，再在控制台运行预先编好的建造程序，然后，这些纳米机器人就开始建造了。
首先，是自我复制，纳米机器人就像微生物一样，以几何级数的速度开始自我复制，几分钟数量就翻一番，直到数量达到预定值的时候才停止。紧接着，这些纳米机器人就开始搬运原子、分子，消耗着能量体的能量，同时培养缸也在给能量体充电。就这样，数小时之后，一把08式自动步枪（刘云擅自命名的自动步枪）就成型了，其“生长过程”就像胚胎的发育一样，刘云可是按照模仿生物的宗旨设计的。与此同时，三十发弹药也已经“长成”，子弹里面的发射药不是湿的，因为自有纳米机器人把里面的水分子搬走，很神奇的功能。
从08式自动步枪开始生长，到形成成品，只需五个小时的时间，此时，刘云将枪支捡起来，甩掉上面的残留培养液，然后装上弹药……“突突突！”刘云向沙袋开了几枪，这步枪竟然能正常使用！而且他的心神扫描表面，这支步枪和通常生产的步枪没有什么两样，完全合格！这就证明数量庞大的纳米机器人确实能够建造宏观的东西。
“神奇！太神奇了！这预示着纳米时代的大门，正式开启！”刘云不由得惊叹道。
有了纳米机器人，刘云就有了“万能制造机”，通过模仿生物生长的方式，刘云完全可以在巨型培养箱里制造他想要的任何大型机械，甚至是军舰也可以制造！不久，刘云就拥有了第一辆“基地车”，可以通过基地车来生产各种建筑，然后制造各种机械、车辆、船只和飞机。
这种基地车，其功能更像《红色警戒3》里面升阳帝国的基地车，虽然刘云很讨厌小日本，但红警3里面小日本用纳米技术来建造各种建筑和单位的方式确实很先进。这不能怪谁，只能怪EA的人干嘛把这么好的创意用在小日本这个阵营上。基地车重280吨，超重的一辆载具，外形就像一辆巨型坦克。这么重的重量，是因为里面装载了大量的纳米核心，其中有一些可复制的纳米核心，剩下的就是可以拉出去建造的纳米建造核心。除此之外，还装了许多“培养包”和“能量包”。建造之时，先从基地车里开出一辆小车，小车里装着一个打包的纳米核心和足够的培养包、能量包，这样就是一个可以展开的纳米核心了，就像红警3里面的纳米核心一样。到了制定地点，那么小车本身就成了容器，然后纳米核心开始利用培养包和能量包里面的